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(A Chain peptide fragment (2091-2108))

(A Chain peptide fragment (2091-2108)) 一、基础信息中文名称A 链肽片段 (2091‑2108)三字母序列Cys-Ser-Arg-Ala-Arg-Lys-Gln-Ala-Ala-Ser-Ile-Lys-Val-Ala-Val-Ser-Ala-Asp-Arg单字母序列CSRARKQAASIKVAVSADR氨基酸数量18 个氨基酸线性多肽无末端酰胺化修饰N 端游离氨基C 端游离羧基。N 端含有半胱氨酸Cys自带游离巯基 (-SH)可发生二硫键形成。分子式C82H149N31O26S分子量2017.35 Da等电点 pI10.72属于碱性多肽。溶解性水溶性较好可溶于水、PBS 缓冲液溶液偏中性 / 弱碱性条件下溶解度更高。该肽含有多个碱性残基 Arg、Lys同时存在 Asp 酸性残基。结构式二、结构特征与改造意义该片段为大分子蛋白 A 链 2091–2108 位的天然序列片段无环化无 D 型氨基酸无磷酸化、荧光标记等人工修饰。序列中包含大量 Ala丙氨酸Ala 富集区域易形成 α 螺旋倾向Ile、Val 疏水残基集中在中段提供疏水相互作用位点N 端 Cys 是关键特征游离巯基可用于与载体蛋白偶联、荧光标记、固定到固相载体也会随存放自发氧化形成二硫键造成肽聚集。 序列内富含碱性氨基酸Arg、Lys是蛋白上的带电结合区域负责和其他蛋白、核酸或者细胞膜发生相互作用。三、作用机理作为蛋白 A 链的天然肽片段该多肽保留了母蛋白该区段的分子识别位点主要依靠静电相互作用、疏水作用实现分子结合。大量带正电的 Lys、Arg 残基能够和带负电的生物大分子磷脂、糖胺聚糖、核酸、蛋白酸性结构域产生静电吸引疏水残基 Ile、Val、Ala 参与疏水界面的识别与结合。N 端 Cys 的巯基可参与氧化还原介导的蛋白交联。 该肽本身一般不具备酶催化活性主要作为结合结构域片段用来模拟母蛋白这一段的相互作用在体外体系中结合对应的受体 / 配体。四、应用领域蛋白 - 蛋白相互作用研究用于体外 pull‑down、ELISA、SPR 表面等离子共振实验验证母蛋白该区域和其相互作用分子的结合能力定位关键结合位点。0抗体开发与抗原制备此片段可作为免疫抗原制备靶向母蛋白 A 链 2091‑2108 区域的多克隆 / 单克隆抗体N 端 Cys 可用于 KLH、BSA 载体偶联。分子互作位点突变与构效关系SAR研究单点突变序列中 Arg/Lys/Ala 等残基研究每个氨基酸对结合活性的贡献确定核心结合位点。细胞水平结合实验用于细胞孵育检测多肽和细胞膜表面分子结合考察细胞粘附、结合相关的功能。质控对照肽在母蛋白的生化检测实验中用作阳性对照肽。五、药物研发价值该多肽本身只是蛋白片段不是候选药物不直接作为给药分子开发。它主要作为工具分子用于解析大分子靶蛋白的结合界面辅助药物靶点验证。 潜在限制游离 Cys 易氧化聚集多肽在体内易被肽酶水解半衰期短难以直接体内给药。如果后续开发成靶向药物先导物一般需要做修饰如 D 氨基酸替换、环化、PEG 修饰提升稳定性。六、研究进展这类长蛋白片段肽是结构生物学与蛋白互作领域常用合成肽。科研上常直接固相合成该区段代替全长大分子蛋白 —— 全长蛋白表达纯化难度高、分子量大用短合成肽片段可以快速、低成本单独研究局部区域功能。 文献中这类片段多用于映射抗原表位或者绘制蛋白相互作用图谱很多研究通过截短、点突变该序列缩小结合的最小基序范围。该序列的 Cys 是实验中重点关注位点氧化是最常见的实验干扰因素。七、理化特性与实验注意事项含有游离巯基Cys极易氧化配液、分装操作尽量在惰性气体氮气环境下更佳水溶液中氧化会产生二硫键二聚体出现沉淀影响实验结果。280nm 无明显紫外吸收序列不含 Tyr、Trp不能直接用 A280 测浓度推荐使用 BCA、Bicinchoninic acid 法或者氨基酸定量来测定多肽浓度。碱性多肽在低 pH 缓冲体系溶解度会下降尽量选用 pH7.0–8.0 中性缓冲液配制。避免反复冻融反复冻融将加速巯基氧化产生聚合物。溶液中可按需添加 DTT/TCEP 还原剂抑制二硫键生成但如果后续偶联标记则不能添加还原剂。八、储存规范冻干粉末-20℃密封避光长期保存若存放时间超过半年推荐 - 80℃干燥保存防潮。多肽水溶液使用前现配快速分装成小体积-80℃保存尽量减少冻融次数。水溶液室温放置稳定性差巯基氧化随时间快速增加。
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